RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 HSPB2Q16082 182 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 THEM4Q5T1C6 240 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZNF691Q5VV52 312 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 KRT80Q6KB66 452 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 USP51Q70EK9 711 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 AAED1Q7RTV5 226 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 FAM122BQ7Z309 247 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CD163Q86VB7 1156 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GID4Q8IVV7 300 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CCDC103Q8IW40 242 aa8.3□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZNF566Q969W8 418 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TRIB1Q96RU8 372 aa8.3□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CLN6Q9NWW5 311 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 B3GAT1Q9P2W7 334 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MOKQ9UQ07 419 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 MED12LQ86YW9 2145 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 DOCK7Q96N67 2140 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GUH1 482 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 IRGMA1A4Y4 181 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PRSS37A4D1T9 235 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 H0YC42 278 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PRODHO43272 600 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 IL18BPO95998 194 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 OPRM1P35372 400 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SLC25A1P53007 311 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 BIDP55957 195 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PER3P56645 1201 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CLDN17P56750 224 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CLRN1P58418 232 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 CXCR4P61073 352 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 OCLNQ16625 522 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 SLC35D3Q5M8T2 416 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 ZNF519Q8TB69 540 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 TMEM163Q8TC26 289 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 ASB6Q9NWX5 421 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.28□□□□□ -1.08
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CS-220ENST00000550700 ZNF432O94892 652 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-220ENST00000550700 PAX7P23759 505 aa8.28□□□□□ -1.08
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