RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531867.1

PUM1-222, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 4

Gene PUM1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-222	ENST00000531867	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61	1e-6	■□□□□ 9.5
PUM1-222	ENST00000531867		A0A0A0MQY5	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867		K7EQM0	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SSX4	O60224	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	LRAT	O95237	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	IFNA16	P05015	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	TFPI	P10646	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ANXA8	P13928	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF708	P17019	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	PIK3R1	P27986	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CHAT	P28329	748 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NMBR	P28336	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	GRIA1	P42261	906 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NR4A2	P43354	598 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	MAGEB1	P43366	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	LIM2	P55344	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CLDN18	P56856	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	BTN3A2	P78410	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	REEP5	Q00765	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	EGR4	Q05215	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SERTAD2	Q14140	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	TWIST1	Q15672	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	PDK4	Q16654	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	UEVLD	Q8IX04	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	C3orf56	Q8N813	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SNF8	Q96H20	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	RILP	Q96NA2	401 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	VCX2	Q9H322	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	PDE10A	Q9Y233	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CAD	P27708	2225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867		E9PI62	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	TP53I11	O14683	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CDH16	O75309	829 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	RHBDL1	O75783	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	VENTX	O95231	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	GAS8	O95995	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	PAH	P00439	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CLPS	P04118	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SERPIND1	P05546	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	LIPF	P07098	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	FGF4	P08620	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	RPA2	P15927	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CD22	P20273	847 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	HNF1A	P20823	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	GABRA5	P31644	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CETN2	P41208	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	MTCP1	P56278	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SST	P61278	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	HSF2	Q03933	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	SRY	Q05066	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	STX4	Q12846	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	MELK	Q14680	651 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	PDK3	Q15120	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUM1-222	ENST00000531867	CENPU	Q71F23	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms