RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520038.1

ARF1P3-201, Transcript of ADP ribosylation factor 1 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene ARF1P3, Length 511 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P3-201ENST00000520038 SKA3Q8IX90 412 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 GPR137CQ8N3F9 429 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 LRRC17Q8N6Y2 441 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 SCAIQ8N9R8 606 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TMEM54Q969K7 222 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 YIPF5Q969M3 257 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TPK1Q9H3S4 243 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 KCNS2Q9ULS6 477 aa9.27□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 FAM157AC9JC47 383 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 RP2O75695 350 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 B4GALT1P15291 398 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 FUT4P22083 530 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 RUNX1T1Q06455 604 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 PIGFQ07326 219 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 DAG1Q14118 895 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 CARTPTQ16568 116 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TTMPQ5BVD1 217 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 CROCCP2Q86T23 111 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 UEVLDQ8IX04 471 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 SMYD1Q8NB12 490 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 SNX18Q96RF0 628 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TMEM43Q9BTV4 400 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.26□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TGDSO95455 350 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 AVPP01185 164 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 OPN1SWP03999 348 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 IFNGR1P15260 489 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 GLRXP35754 106 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 ALDH3B1P43353 468 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 GIPRP48546 466 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 ERVS71-1P61550 626 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 LMO4P61968 165 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 PUDPQ08623 228 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 RAB39AQ14964 217 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 ZNF74Q16587 644 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 AGKQ53H12 422 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 ZNF813Q6ZN06 617 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 PXKQ7Z7A4 578 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 HPS1Q92902 700 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TAMM41Q96BW9 452 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TSPAN32Q96QS1 320 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 SEPHS2Q99611 448 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 FOXB1Q99853 325 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 SYT3Q9BQG1 590 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 RAB1BQ9H0U4 201 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 ARMC7Q9H6L4 198 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 FZR1Q9UM11 496 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 USP22Q9UPT9 525 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.25□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 C5orf58C9J3I9 102 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 M0QX08 132 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 SYNGR3O43761 229 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 FMO6PO60774 539 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 CLPTM1O96005 669 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 TSPAN19P0C672 248 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 ASAH2BP0C7U1 165 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 PGA4P0DJD7 388 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 PGA3P0DJD8 388 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 CD79AP11912 226 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 RBMXP38159 391 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 EVX1P49640 407 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 ATP4BP51164 291 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 BIDP55957 195 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 MTPNP58546 118 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 RAB1AP62820 205 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 ZP4Q12836 540 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 PMS2P3Q13401 168 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 CCNIQ14094 377 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 HIST3H3Q16695 136 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 GSG1Q2KHT4 349 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.24□□□□□ -0.93
ARF1P3-201ENST00000520038 CCDC36Q8IYA8 594 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms