RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 CXCR6O00574 342 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 TO15178 435 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CLOCKO15516 846 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 SCN2BO60939 215 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 SULT1C4O75897 302 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 TNFSF15O95150 251 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 SOD1P00441 154 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 FTH1P02794 183 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CTSLP07711 333 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 HTR1AP08908 422 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 OR56A5P0C7T3 313 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 THRBP10828 461 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 PRPS2P11908 318 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 NELFEP18615 380 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CYP2A7P20853 494 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CDH3P22223 829 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CA6P23280 308 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ACSL1P33121 698 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CDKN2CP42773 168 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 HLCSP50747 726 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 PFN3P60673 137 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CHRNB3Q05901 458 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 KLRB1Q12918 225 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 EPS8Q12929 822 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 IL18R1Q13478 541 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 NR1D2Q14995 579 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 IGFBP7Q16270 282 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 IMPG1Q17R60 797 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ZBED5Q49AG3 693 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 BCL7AQ4VC05 210 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 LRRC73Q5JTD7 316 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CCNJQ5T5M9 372 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM215Q68D42 235 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 GLYATQ6IB77 296 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 IYDQ6PHW0 289 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF773Q6PK81 442 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 PXKQ7Z7A4 578 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 SLC22A15Q8IZD6 547 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 OFCC1Q8IZS5 231 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 DHRSXQ8N5I4 330 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 OR4C6Q8NH72 309 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 GANCQ8TET4 914 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM159Q96B96 161 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ISOC1Q96CN7 298 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 WDR34Q96EX3 536 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 DTD2Q96FN9 168 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 OR52E6Q96RD3 313 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CHID1Q9BWS9 393 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ACTR8Q9H981 624 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 C12orf10Q9HB07 376 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 VNN3Q9NY84 501 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 FBXL17Q9UF56 701 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 SNX6Q9UNH7 406 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 V9GYQ6 96 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.65□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 E7EQ34 232 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 H0YIV9 168 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 H3BMQ9 156 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 M0QX08 132 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 HAT1O14929 419 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 MAGEB3O15480 346 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 DPM1O60762 260 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 SEC22BO75396 215 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CREG1O75629 220 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CLIC3O95833 236 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 ERGP11308 486 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 GPX2P18283 190 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 PRPS1L1P21108 318 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 CRHBPP24387 322 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 IMPA1P29218 277 aa3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
RUFY3-215ENST00000515479 S100A3P33764 101 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms