RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 PTPRFP10586 1907 aa1.86□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CENPFP49454 3210 aa1.86□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LAMA3Q16787 3333 aa1.86□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC37A2A6NM11 1700 aa1.86□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PPV4 95 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 IGLON5A6NGN9 336 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 MPTX1A8MV57 137 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 G3V4G9 280 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 DENRO43583 198 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 NGFRP08138 427 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ANXA5P08758 320 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SDC1P18827 310 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINA2P20848 420 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 BDKRB1P46663 353 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 RIDAP52758 137 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM50BP56557 158 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 VGLL4Q14135 290 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM187Q14656 261 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ALX1Q15699 326 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 HLA-BQ31612 363 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 AGBL2Q5U5Z8 902 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 REP15Q6BDI9 236 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SLC8B1Q6J4K2 584 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 DEGS2Q6QHC5 323 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC6Q86X45 466 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 C10orf67Q8IYJ2 551 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 SVOPLQ8N434 492 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OR4F6Q8NGB9 312 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 NRGNQ92686 78 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 TNFRSF14Q92956 283 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 PANX1Q96RD7 426 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LGMNQ99538 433 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 HSD17B14Q9BPX1 270 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CD209Q9NNX6 404 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 DEPPQ9NTK1 212 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 DDX19BQ9UMR2 479 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 NTNG1Q9Y2I2 539 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ATAD5Q96QE3 1844 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CEP290O15078 2479 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 P2RY10O00398 339 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF195O14628 629 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 CHST1O43916 411 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 C2P06681 752 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 GSTM3P21266 225 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 IL32P24001 234 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 HOXA9P31269 272 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 BRCC3P46736 316 aa1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 PEX6Q13608 980 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
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PDE4D-218ENST00000509368 TTC23LQ6PF05 361 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 NUDCD3Q8IVD9 361 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 KIR3DL3Q8N743 410 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 NUP37Q8NFH4 326 aa1.85□□□□□ -2.11
PDE4D-218ENST00000509368 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa1.85□□□□□ -2.11
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