RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 LIPMQ5VYY2 423 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TEX38Q6PEX7 206 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ENPP6Q6UWR7 440 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HORMAD2Q8N7B1 307 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ZFP41Q8N8Y5 198 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR9I1Q8NGQ6 314 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GPR148Q8TDV2 347 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FAM46BQ96A09 425 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 NTNG2Q96CW9 530 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CUTCQ9NTM9 273 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OXSMQ9NWU1 459 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 P4HTMQ9NXG6 502 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 LAMB4A4D0S4 1761 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 WDR27A2RRH5 827 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TRAPPC2LH3BP13 241 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CORTO00230 105 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PROSCO94903 275 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HPXP02790 462 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CFHP08603 1231 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PSMB5P28074 263 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ID1P41134 155 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MAGEA12P43365 314 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TFPI2P48307 235 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 BLKP51451 505 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PNLIPRP1P54315 467 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CLDN12P56749 244 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RBBP4Q09028 425 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ITPK1Q13572 414 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 AWAT1Q58HT5 328 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SPANXN3Q5MJ09 141 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SMARCD2Q92925 531 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SFRP2Q96HF1 295 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FN3KRPQ9HA64 309 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HSPB2A8KAH6 182 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MAN2B1O00754 1011 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 WNT9AO14904 365 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 IFNA5P01569 189 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 LCATP04180 440 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 EBLN1P0CF75 366 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 BMP3P12645 472 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CD58P19256 250 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 IDSP22304 550 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PRKACGP22612 351 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 AGTR1P30556 359 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 GJA5P36382 358 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SOX3P41225 446 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CKS1BP61024 79 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RANP62826 216 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CAPSQ13938 189 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HSPB2Q16082 182 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RAB6CQ53S08 254 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TFDP3Q5H9I0 405 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR2T2Q6IF00 324 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 CALHM1Q8IU99 346 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 APH1BQ8WW43 257 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MCHR2Q969V1 340 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM45BQ96B21 275 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SYT3Q9BQG1 590 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 NOX3Q9HBY0 568 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 VPS29Q9UBQ0 182 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-216ENST00000507116 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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