RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 RHOAP61586 193 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NAA20P61599 178 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35B1P78383 322 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CDKL1Q00532 357 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NHLH2Q02577 135 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 MVKQ03426 396 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 GPR17Q13304 367 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 UBE2V1Q13404 147 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RPEL1Q2QD12 228 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 EIPR1Q53HC9 387 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SYT14P1Q58G82 188 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 MDGA2Q7Z553 956 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NIT1Q86X76 327 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDCD4-211ENST00000498367 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 EMC1Q8N766 993 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ABHD4Q8TB40 342 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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PDCD4-211ENST00000498367 SMIM19Q96E16 107 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDCD4-211ENST00000498367 C20orf173Q96LM9 149 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 KCTD7Q96MP8 289 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 GPR78Q96P69 363 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PNKPQ96T60 521 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RHOJQ9H4E5 214 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 GLTPQ9NZD2 209 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 EBF1Q9UH73 591 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDCD4-211ENST00000498367 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDCD4-211ENST00000498367 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.48□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.48□□□□□ -1.37
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PDCD4-211ENST00000498367 OR6C6A6NF89 314 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PPP5D1E7EU14 171 aa6.47□□□□□ -1.37
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PDCD4-211ENST00000498367 TAPBPO15533 448 aa6.47□□□□□ -1.37
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PDCD4-211ENST00000498367 EML2O95834 649 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ADRB1P08588 477 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SNHG28P0DPA3 235 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 AKR1C4P17516 323 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CD58P19256 250 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ATP6V1B2P21281 511 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ANOS1P23352 680 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CEACAM6P40199 344 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF77Q15935 545 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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PDCD4-211ENST00000498367 ZNF534Q76KX8 674 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 THAP8Q8NA92 274 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 FNDC8Q8TC99 324 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 ASB10Q8WXI3 467 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 BAALCQ8WXS3 180 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM80Q96HE8 168 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 DSN1Q9H410 356 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NIPAL2Q9H841 368 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 EBF2Q9HAK2 575 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 Q9N2K0 584 aa6.47□□□□□ -1.37
PDCD4-211ENST00000498367 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.47□□□□□ -1.37
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