RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 A0A096LPE4 126 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPZ6 126 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 hCG_2039718K7EN88 272 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 F13BP05160 661 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 RHCEP18577 417 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 HOXC12P31275 282 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MELKQ14680 651 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 LAPTM4AQ15012 233 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD16Q6P6B7 361 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 KLHL17Q6TDP4 642 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ZNF611Q8N823 705 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 OR6N1Q8NGY5 312 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MOSPD2Q8NHP6 518 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TMEM54Q969K7 222 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 OBP2BQ9NPH6 170 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 V9GYQ6 96 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRQ8 180 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SHISA9B4DS77 424 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 M0R1B8 84 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ABCD4O14678 606 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 DIRAS1O95057 198 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 BCL10O95999 233 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 WNT11O96014 354 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PTAFRP25105 342 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 CD40P25942 277 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 DGCR6Q14129 220 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TMEM108Q6UXF1 575 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SPNS3Q6ZMD2 512 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ZNF730Q6ZMV8 503 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP24Q8N264 748 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A13Q8TCU3 470 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 IGFBPL1Q8WX77 278 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PIGTQ969N2 578 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 INIPQ9NRY2 104 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R1Q9NYW7 299 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 HIF3AQ9Y2N7 669 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 H1F0P07305 194 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 CSNK1A1P48729 337 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 FHL1Q13642 323 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PODNL1Q6PEZ8 512 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 KLHL24Q6TFL4 600 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 DHRS1Q96LJ7 313 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 CCL19Q99731 98 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PIP5K1AQ99755 562 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ULBP2Q9BZM5 246 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 C1orf21Q9H246 121 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 GLTPQ9NZD2 209 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ACTR3BQ9P1U1 418 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MGAT4BQ9UQ53 548 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRG6 482 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB9A8MZ26 197 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ITGA2P17301 1181 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1B2P21281 511 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TUBA1BP68363 451 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TUBA4AP68366 448 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 RUNX1T1Q06455 604 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SPOCK1Q08629 439 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 LRFN4Q6PJG9 635 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 CYP2R1Q6VVX0 501 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TUBA1AQ71U36 451 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ZNF627Q7L945 461 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 LRRC75AQ8NAA5 344 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ZNF566Q969W8 418 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 RADILQ96JH8 1075 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 SEC14L2O76054 403 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 UBOX5O94941 541 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PGA4P0DJD7 388 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PGA3P0DJD8 388 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MS4A2Q01362 244 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ALG10Q5BKT4 473 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 CDK20Q8IZL9 346 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 OR51A7Q8NH64 312 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 ASB10Q8WXI3 467 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 FBXW5Q969U6 566 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 FUZQ9BT04 418 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 POFUT2Q9Y2G5 429 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 DSCAMO60469 2012 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTB-211ENST00000480301 TRAV27A0A087WT01 109 aa18.27■□□□□ 0.52
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