RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM80Q96HE8 168 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 LRR1Q96L50 414 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 KLHL15Q96M94 604 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SFXN2Q96NB2 322 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OXGR1Q96P68 337 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RNF122Q9H9V4 155 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GP6Q9HCN6 339 aa6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 TMCC2O75069 709 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SOX14O95416 240 aa6.29□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 DNASE1L1P49184 302 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 H3F3AP84243 136 aa6.29□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 FOXF1Q12946 379 aa6.29□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 RELTQ969Z4 430 aa6.29□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 OR5B2Q96R09 309 aa6.29□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 ALG12Q9BV10 488 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.29□□□□□ -1.4
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SHQ1-207ENST00000475558 RASSF1Q9NS23 344 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 FKBP7Q9Y680 259 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZFHX3Q15911 3703 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 AKAP9Q99996 3911 aa6.29□□□□□ -1.4
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