RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466154.5

SLX4-202, Transcript of SLX4 structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLX4, Length 3,228 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4-202ENST00000466154 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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SLX4-202ENST00000466154 IL33O95760 270 aa14.84□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 OPN1LWP04000 364 aa14.84□□□□□ -0.03
SLX4-202ENST00000466154 CCKBRP32239 447 aa14.84□□□□□ -0.03
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SLX4-202ENST00000466154 OR1L3Q8NH93 324 aa14.83□□□□□ -0.03
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SLX4-202ENST00000466154 SYT13Q7L8C5 426 aa14.83□□□□□ -0.04
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SLX4-202ENST00000466154 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.83□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
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SLX4-202ENST00000466154 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.82□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 OR8H3Q8N146 312 aa14.82□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.82□□□□□ -0.04
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SLX4-202ENST00000466154 ZNF81P51508 661 aa14.82□□□□□ -0.04
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SLX4-202ENST00000466154 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.82□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 GHITMQ9H3K2 345 aa14.82□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.82□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.82□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 VDAC3Q9Y277 283 aa14.82□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 H0YIG0 161 aa14.81□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.81□□□□□ -0.04
SLX4-202ENST00000466154 ADRA2CP18825 462 aa14.81□□□□□ -0.04
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