RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	CNIH2	Q6PI25	160 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	COX15	Q7KZN9	410 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	CEP112	Q8N8E3	955 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	NPB	Q8NG41	125 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	ACER1	Q8TDN7	264 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF799	Q96GE5	643 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	OR2M2	Q96R28	347 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	CLMP	Q9H6B4	373 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	XCL2	Q9UBD3	114 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	NUP50	Q9UKX7	468 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	MSH6	P52701	1360 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	HEATR9	A2RTY3	570 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF716	A6NP11	495 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	MOS	P00540	346 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	CST1	P01037	141 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	SERPIND1	P05546	499 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF735	P0CB33	412 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	CCNC	P24863	283 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	CHML	P26374	656 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	TFPI2	P48307	235 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	FZD2	Q14332	565 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	TGFBI	Q15582	683 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	RFX4	Q33E94	735 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	LCN12	Q6JVE5	192 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM107	Q6UX40	140 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	PEX26	Q7Z412	305 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	GPR151	Q8TDV0	419 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	RNF139	Q8WU17	664 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	RASD2	Q96D21	266 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	PISD	Q9UG56	409 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	NEU3	Q9UQ49	428 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CLK1-208	ENST00000464454	SCN2A	Q99250	2005 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454		A6NDX4	124 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454		H3BNH8	94 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	DLGAP1	O14490	977 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	CA11	O75493	328 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	CRYGB	P07316	175 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	CSF3	P09919	207 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	GKN3P	P0CG01	181 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	GDI1	P31150	447 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	H2AFV	Q71UI9	128 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM135	Q86UB9	458 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF429	Q86V71	674 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454		Q8N9W7	124 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	MED8	Q96G25	268 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	CNDP1	Q96KN2	507 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	FAM210B	Q96KR6	192 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	RARRES2	Q99969	163 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC77	Q9BR77	488 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	LAD1	O00515	517 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	PEX7	O00628	323 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	XKRY	O14609	159 aa		2.7	□□□□□ -1.98
CLK1-208	ENST00000464454	GOSR2	O14653	212 aa		2.7	□□□□□ -1.98

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