RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 ANKS4BQ8N8V4 417 aa16.98■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.98■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 TAMM41Q96BW9 452 aa16.98■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 LRR1Q96L50 414 aa16.98■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 SH3GL1Q99961 368 aa16.98■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 ECSITQ9BQ95 431 aa16.98■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 NANOGQ9H9S0 305 aa16.98■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 NANSQ9NR45 359 aa16.98■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 CR1P17927 2039 aa16.98■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 FBP2O00757 339 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 RNF13O43567 381 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 HIST1H2ABP04908 130 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 IFNGR1P15260 489 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 B4GALT1P15291 398 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 CSNK1A1P48729 337 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 BIDP55957 195 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 GSG1Q2KHT4 349 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 KRT80Q6KB66 452 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 LINC00114Q6XXX2 140 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 WDR88Q6ZMY6 472 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 NUP37Q8NFH4 326 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 PROX1Q92786 737 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 HIST1H2ACQ93077 130 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 PIMREGQ9BSJ6 248 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 SAR1AQ9NR31 198 aa16.97■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 A0A096LNT2 108 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 SH3PXD2BA1X283 911 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 hCG_2039718K7EN88 272 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 PDE5AO76074 875 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 NPR2P20594 1047 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 USF1P22415 310 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 THBS4P35443 961 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 HGFACQ04756 655 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 DAG1Q14118 895 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 GGTLC2Q14390 218 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF74Q16587 644 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 RABL3Q5HYI8 236 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA21Q7Z572 469 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC58Q96CX6 371 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 MRGBPQ9NV56 204 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.96■□□□□ 0.31
NPAS1-201ENST00000439365 MRASO14807 208 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 RAB36O95755 333 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 THY1P04216 161 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 KLF10Q13118 480 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 EFNB3Q15768 340 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 REP15Q6BDI9 236 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 WDFY1Q8IWB7 410 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 SVOPLQ8N434 492 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 C10orf82Q8WW14 230 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 MPP4Q96JB8 637 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 KCNK17Q96T54 332 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 MDFIQ99750 246 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 FOXB1Q99853 325 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 RAB1BQ9H0U4 201 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 PLK3Q9H4B4 646 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 NOX3Q9HBY0 568 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.96■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 KRT34O76011 436 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 GZMMP51124 257 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 TAS2R41P59536 307 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 VLDLRP98155 873 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 MELKQ14680 651 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 MAPRE2Q15555 327 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 IQCCQ4KMZ1 466 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 CYB5R2Q6BCY4 276 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 DEF8Q6ZN54 512 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 CARM1Q86X55 608 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF566Q969W8 418 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF442Q9H7R0 627 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 ABCA1O95477 2261 aa16.94■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 BBIP1A8MTZ0 92 aa16.94■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16.94■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 NDUFS8O00217 210 aa16.94■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
NPAS1-201ENST00000439365 LYPD3O95274 346 aa16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms