RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 FGD3Q5JSP0 725 aa15.79■□□□□ 0.12
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HERC3-205ENST00000426683 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-205ENST00000426683 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.79■□□□□ 0.12
HERC3-205ENST00000426683 CDK20Q8IZL9 346 aa15.79■□□□□ 0.12
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HERC3-205ENST00000426683 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HERC3-205ENST00000426683 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
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HERC3-205ENST00000426683 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
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HERC3-205ENST00000426683 CDC42EP2O14613 210 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-205ENST00000426683 PGA4P0DJD7 388 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-205ENST00000426683 PGA3P0DJD8 388 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-205ENST00000426683 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HERC3-205ENST00000426683 RRM2P31350 389 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-205ENST00000426683 CLRN1P58418 232 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-205ENST00000426683 SMIM11AP58511 58 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-205ENST00000426683 RUNX1T1Q06455 604 aa15.75■□□□□ 0.11
HERC3-205ENST00000426683 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
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