RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 POU2F1P14859 743 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 IL18Q14116 193 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 POU4F3Q15319 338 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 PLA1AQ53H76 456 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 PODNL1Q6PEZ8 512 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 RNF138Q8WVD3 245 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 SCMH1Q96GD3 660 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 IL20Q9NYY1 176 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 COMMD3Q9UBI1 195 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 REV1Q9UBZ9 1251 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 GLS2Q9UI32 602 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 SLC7A7Q9UM01 511 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 MGAT4BQ9UQ53 548 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 HRH3Q9Y5N1 445 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 A0A0A6YYJ9 748 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 IRGMA1A4Y4 181 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 LYPD3O95274 346 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 SSR4P51571 173 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 CCR4P51679 360 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ZSWIM7Q19AV6 140 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 CASP12Q6UXS9 341 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ZNF550Q7Z398 422 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 IP6K3Q96PC2 410 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ZNF559Q9BR84 538 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 A0A1B0GVI7 797 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 CIB4A0PJX0 185 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 FMO6PO60774 539 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 OR5F1O95221 314 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ZP3P21754 424 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 P2RY14Q15391 338 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 DCST1Q5T197 706 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 OR5M10Q6IEU7 315 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 WDR88Q6ZMY6 472 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 DUSP19Q8WTR2 217 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 PHF21AQ96BD5 680 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 GHITMQ9H3K2 345 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD10Q9NXR5 420 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 HCRTR2O43614 444 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 GABRA5P31644 462 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 PTGDSP41222 190 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 GAS1P54826 345 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 WNT4P56705 351 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ST3GAL3Q11203 375 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 FAM26EQ8N5C1 309 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TM9SF4Q92544 642 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 OR2M2Q96R28 347 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ATF6BQ99941 703 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 PRSS27Q9BQR3 290 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 KIF25Q9UIL4 384 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 A0A087WUU8 490 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 A0A1B0GWA3 101 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TMEM129A0AVI4 362 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TRAPPC13A5PLN9 417 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TSPAN4O14817 238 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 HPGDSO60760 199 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 POU1F1P28069 291 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ACER2Q5QJU3 275 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 HACD4Q5VWC8 232 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 OPN5Q6U736 354 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 LAT2Q9GZY6 243 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 APC2O95996 2303 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa22.11■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ARGFXA6NJG6 315 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ITGA3P26006 1051 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 SMIM11AP58511 58 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TRAM2Q15035 370 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TIGD4Q8IY51 512 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TMEM156Q8N614 296 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 OR52I1Q8NGK6 324 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TMEM255BQ8WV15 326 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 EVA1AQ9H8M9 152 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 KLRF1Q9NZS2 232 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ICAM5Q9UMF0 924 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 A0A0B4J2E0 115 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 A0A1B0GX12 115 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 A0A1W2PRG6 482 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 MST1P26927 711 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 GPR176Q14439 515 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TMEM81Q6P7N7 255 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 BEST3Q8N1M1 668 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 ACOT12Q8WYK0 555 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 UFD1Q92890 307 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 TMEM27Q9HBJ8 222 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU1-201ENST00000421832 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms