RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 AVL9Q8NBF6 648 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5AK2Q8NH90 309 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MARVELD3Q96A59 401 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MSANTD3Q96H12 275 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MOGAT1Q96PD6 335 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 COQ3Q9NZJ6 369 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RABL2BQ9UNT1 228 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MAB21L2Q9Y586 359 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RP1P56715 2156 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TVP23AA6NH52 213 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 GLULP15104 373 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS27P42677 84 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ART1P52961 327 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB14P61106 215 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 IKZF1Q13422 519 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ELOA3Q8NG57 546 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RADILQ96JH8 1075 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 FRRS1LQ9P0K9 344 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SPEF1Q9Y4P9 236 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 DCTN6O00399 190 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MAS1P04201 325 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MAOAP21397 527 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CTXN1P60606 82 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PLA2G7Q13093 441 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 Q499Y3 187 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 OR8K3Q8NH51 312 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 HAVCR1Q96D42 359 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 GUCD1Q96NT3 240 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 DGAT2Q96PD7 388 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA4CQ9C0C4 833 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SLITRK2Q9H156 845 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF224Q9NZL3 707 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PI4KAP42356 2102 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF2O60811 474 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 UPK3AO75631 287 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB40ALP0C0E4 278 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MYF5P13349 255 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TAS2R20P59543 309 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 DMWDQ09019 674 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 IL10RAQ13651 578 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 IDO2Q6ZQW0 420 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH24Q86UP0 819 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6V1Q8N148 313 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB40AQ8WXH6 277 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNN3Q9UGI6 736 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 IKZF2Q9UKS7 526 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SULT1B1O43704 296 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFP01375 233 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TACSTD2P09758 323 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RNH1P13489 461 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 OPCMLQ14982 345 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 AANATQ16613 207 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC6A19Q695T7 634 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC16A9Q7RTY1 509 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PIPOXQ9P0Z9 390 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 OIP5O43482 229 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CBFBQ13951 182 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ALG10Q5BKT4 473 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PARGQ86W56 976 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 EID2Q8N6I1 236 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MIB2Q96AX9 1013 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJA3Q96EY1 480 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC61Q9BV99 259 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10A5Q9H207 317 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 POMT2Q9UKY4 750 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PPC4 97 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 OR5K3A6NET4 321 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 B8ZZF3 427 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOT7O00154 380 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 GUSBP08236 651 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CALCBP10092 127 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 M6PRP20645 277 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 BCKDHBP21953 392 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ITPKBP27987 946 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR3P46089 330 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 RABIFP47224 123 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 ISXQ2M1V0 245 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms