RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411039.1

RNA5SP222-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 222, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP222, Length 105 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP222-201ENST00000411039 LHX2P50458 406 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 RAB9AP51151 201 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ZNF136P52737 540 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 HSPA2P54652 639 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 CLDN18P56856 261 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 TAS2R39P59534 338 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 KRTAP12-2P59991 146 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 RAB10P61026 200 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ACTR1AP61163 376 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 RAP1BP61224 184 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 RPS8P62241 208 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 RPS14P62263 151 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 KCNJ2P63252 427 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ZNF92Q03936 586 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 SMARCB1Q12824 385 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 PLD1Q13393 1074 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 KIAA0087Q14695 138 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 NCF4Q15080 339 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 SGCAQ16586 387 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 DUSP7Q16829 419 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 TTLL9Q3SXZ7 439 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 VPS26BQ4G0F5 336 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 GGTA1PQ4G0N0 100 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 TP53I3Q53FA7 332 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 CARD16Q5EG05 197 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 XKR4Q5GH76 650 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 TFDP3Q5H9I0 405 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 BEX5Q5H9J7 111 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 C10orf120Q5SQS8 335 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 LDLRAP1Q5SW96 308 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 AVPI1Q5T686 147 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 GPR157Q5UAW9 335 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 RAET1LQ5VY80 246 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ANKRD22Q5VYY1 191 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 STUMQ69YW2 141 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 CTRB2Q6GPI1 263 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ZNF544Q6NX49 715 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 TTC23LQ6PF05 361 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 CASC1Q6TDU7 716 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 KDELC1Q6UW63 502 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ENPP6Q6UWR7 440 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 TMEM107Q6UX40 140 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 IGFL3Q6UXB1 125 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 TEX43Q6ZNM6 134 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 Q6ZR03 302 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 PGAP1Q75T13 922 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 TCF24Q7RTU0 167 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ASCL5Q7RTU5 278 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ZNF546Q86UE3 836 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 VSTM4Q8IW00 320 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 C12orf56Q8IXR9 622 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 CCDC65Q8IXS2 484 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 PIANPQ8IYJ0 282 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 TBC1D21Q8IYX1 336 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 IQCKQ8N0W5 287 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 PDIK1LQ8N165 341 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 LINC01561Q8N1V8 128 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 C6orf223Q8N319 242 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 MREGQ8N565 214 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 TPRX1Q8N7U7 411 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 C15orf56Q8N910 161 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 UBAC2Q8NBM4 344 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 CCDC54Q8NEL0 328 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 OR51G2Q8NGK0 314 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 OR5D13Q8NGL4 314 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 OR2A1Q8NGT9 310 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 OR10R2Q8NGX6 335 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 OR2L8Q8NGY9 312 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 OR10G6Q8NH81 332 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 RHEBL1Q8TAI7 183 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 CNIH3Q8TBE1 160 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ZNF596Q8TC21 504 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 ACTRT1Q8TDG2 376 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 SCFD1Q8WVM8 642 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 C17orf50Q8WW18 174 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 RAPGEF5Q92565 580 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 SMARCD2Q92925 531 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 SLC38A4Q969I6 547 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 FAM104AQ969W3 186 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 MARC2Q969Z3 335 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 NTAN1Q96AB6 310 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 MCUR1Q96AQ8 359 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 CREB3L1Q96BA8 519 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 C10orf35Q96D05 121 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 MS4A14Q96JA4 679 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 HSFY1Q96LI6 401 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa0.43□□□□□ -2.34
RNA5SP222-201ENST00000411039 OXGR1Q96P68 337 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms