RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 RPL3P39023 403 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 PYURFQ96I23 114 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 MS4A10Q96PG2 267 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 ZNF426Q9BUY5 554 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 AHSPQ9NZD4 102 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 KCNMB2Q9Y691 235 aa12.69□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD61A6NGH8 418 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 FGF2P09038 288 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 ABOP16442 354 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 CASRP41180 1078 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 CD200P41217 278 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 CAV3P56539 151 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 KRTCAP3Q53RY4 240 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 KIAA0895LQ68EN5 471 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 FAM220AQ7Z4H9 259 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 KCNRGQ8N5I3 272 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 NPWQ8N729 165 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 CLDN22Q8N7P3 220 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 ZNF439Q8NDP4 499 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 PSMF1Q92530 271 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 HAS2Q92819 552 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 FKBP10Q96AY3 582 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 SGCZQ96LD1 299 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 UQCC1Q9NVA1 299 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 FBXW2Q9UKT8 454 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 NCOR1O75376 2440 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 EFSO43281 561 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 DLX3O60479 287 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 IFNGR2P38484 337 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 RING1Q06587 406 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 SPIN4Q56A73 249 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 TIFABQ6ZNK6 161 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 C19orf35Q6ZS72 473 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 NUS1Q96E22 293 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 ZBP1Q9H171 429 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PS29 197 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 LEFTY1O75610 366 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 OR5G3P0C626 314 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 RPL38P63173 70 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 CDK3Q00526 305 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 SLC5A12Q1EHB4 618 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 OR13C4Q8NGS5 318 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 LCN9Q8WX39 176 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 KLHDC7BQ96G42 594 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 HHIPQ96QV1 700 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 MARVELD1Q9BSK0 173 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 SEC11CQ9BY50 192 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 FKBP11Q9NYL4 201 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 EPHA6Q9UF33 1036 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 AK3Q9UIJ7 227 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 SPTA1P02549 2419 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 A6NIZ1 184 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 WDR1O75083 606 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 NPBWR1P48145 328 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 RFX2P48378 723 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 SLC35A2P78381 396 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 OR8S1Q8NH09 359 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 STYXQ8WUJ0 223 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 UBTD2Q8WUN7 234 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 RLN3Q8WXF3 142 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 GPR21Q99679 349 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 KCNH6Q9H252 994 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 ISYNA1Q9NPH2 558 aa12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 RREB1Q92766 1687 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 SDHDO14521 159 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 GABRA1P14867 456 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 OR4D2P58180 307 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 HYAL2Q12891 473 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 KCTD11Q693B1 232 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 TGM7Q96PF1 710 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 MEGF9Q9H1U4 602 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 DOK5Q9P104 306 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 PAM16Q9Y3D7 125 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 MEIKINA0A087WXM9 373 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 CLDN7O95471 211 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 BMP5P22003 454 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 Q6ZVL8 140 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 PNPLA1Q8N8W4 532 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa12.67□□□□□ -0.38
CTIF-202ENST00000382998 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms