RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 V9GYH0 126 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ANTXRLA6NF34 631 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 EDIL3O43854 480 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO45P0C2W1 286 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 NTRK2Q16620 822 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF787Q6DD87 383 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM169Q96HH4 297 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 NFASCO94856 1347 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TLR4O00206 839 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 TUSC2O75896 110 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 STBD1O95210 358 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MATN4O95460 622 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 GTF2F2P13984 249 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR18Q14330 331 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF766Q5HY98 468 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 DNERQ8NFT8 737 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR52E6Q96RD3 313 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CD320Q9NPF0 282 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 IL23AQ9NPF7 189 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WZY1 265 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 WNT11O96014 354 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 JAK3P52333 1124 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.22□□□□□ -1.41
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 CPVLQ9H3G5 476 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 EMCNQ9ULC0 261 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 PSG8Q9UQ74 426 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 MT-ND1P03886 318 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 FABP3P05413 133 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4A8P0C604 315 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 SRFP11831 508 aa6.21□□□□□ -1.41
RABGEF1-202ENST00000380828 ABOP16442 354 aa6.21□□□□□ -1.41
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