RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 EFSO43281 561 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 CD1CP29017 333 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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PTPRM-201ENST00000332175 KIF25Q9UIL4 384 aa20.64■□□□□ 0.89
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PTPRM-201ENST00000332175 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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PTPRM-201ENST00000332175 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 OR52A1Q9UKL2 312 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM221A6NGB7 291 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRM-201ENST00000332175 KCNK2O95069 426 aa20.61■□□□□ 0.89
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