RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 SIRPAP78324 504 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 ZNF45Q02386 682 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 PUDPQ08623 228 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 ZP4Q12836 540 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 HES3Q5TGS1 186 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.09■□□□□ 0.17
ACTB-201ENST00000331789 OR13C5Q8NGS8 318 aa16.09■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.09■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 CHST11Q9NPF2 352 aa16.09■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 PCNX2A6NKB5 2137 aa16.09■□□□□ 0.17
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ACTB-201ENST00000331789 SLC16A7O60669 478 aa16.07■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 SHC1P29353 583 aa16.07■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 TLE3Q04726 772 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 CDK5R1Q15078 307 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 SLC22A10Q63ZE4 541 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 TMEM81Q6P7N7 255 aa16.07■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 CEACAM19Q7Z692 300 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.07■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 RNF32Q9H0A6 362 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 KCNN2Q9H2S1 579 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 MIXL1Q9H2W2 232 aa16.07■□□□□ 0.16
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ACTB-201ENST00000331789 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD10Q9NXR5 420 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ALKBH4Q9NXW9 302 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 FKBP7Q9Y680 259 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 MED12Q93074 2177 aa16.07■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 CFAP54Q96N23 3096 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PNR3 127 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 TBX1O43435 398 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ICAM2P13598 275 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 CTLA4P16410 223 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 CALRP27797 417 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 DLSTP36957 453 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 ACSM3Q53FZ2 586 aa16.06■□□□□ 0.16
ACTB-201ENST00000331789 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.06■□□□□ 0.16
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