RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 CD226Q15762 336 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 COMMD7Q86VX2 200 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF417Q8TAU3 575 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF285Q96NJ3 590 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TSSK2Q96PF2 358 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 GPR174Q9BXC1 333 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 C12orf10Q9HB07 376 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 GPR27Q9NS67 375 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 CDH23Q9H251 3354 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 OR2M5A3KFT3 312 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 SERPINI2O75830 405 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 SEMA4FO95754 770 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 CFDP00746 253 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 DCTDP32321 178 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 C7orf57Q8NEG2 295 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 CEP76Q8TAP6 659 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 LPAR4Q99677 370 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 PBX4Q9BYU1 374 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 GSX2Q9BZM3 304 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM212A6NML5 194 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 OIP5O43482 229 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 MAOAP21397 527 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 MST1P26927 711 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 LTBQ06643 244 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 HYAL1Q12794 435 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 MESTQ5EB52 335 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 OR2G2Q8NGZ5 317 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 NARFLQ9H6Q4 476 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 WDR76Q9H967 626 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 KCNN3Q9UGI6 736 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 DCTN6O00399 190 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 XRCC3O43542 346 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TOXO94900 526 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 IL33O95760 270 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 IGHV4-34P06331 123 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ALOX5APP20292 161 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 RAB14P61106 215 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 DMWDQ09019 674 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 MED25Q71SY5 747 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF227Q86WZ6 799 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 C10orf53Q8N6V4 93 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC20Q8TCA0 184 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 PIGKQ92643 395 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 THRSPQ92748 146 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL15Q96M94 604 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 CA10Q9NS85 328 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 OR6C65A6NJZ3 312 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 H7C417 338 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 PHYHO14832 338 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 GABRG2P18507 467 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 FAUP35544 74 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 HTR4Q13639 388 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 SERTAD2Q14140 314 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 OPCMLQ14982 345 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 MEIOBQ8N635 442 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 DNAAF1Q8NEP3 725 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TSPAN32Q96QS1 320 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 COMMD4Q9H0A8 199 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 GRHPRQ9UBQ7 328 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 MTFP1Q9UDX5 166 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 STEAP1Q9UHE8 339 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 KIF25Q9UIL4 384 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 LAMP5Q9UJQ1 280 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 SOX2P48431 317 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 BIKQ13323 160 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 CCINQ13939 588 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ERV3-1Q14264 604 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 FZD2Q14332 565 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 AANATQ16613 207 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 FDX2Q6P4F2 183 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 GLB1L2Q8IW92 636 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 GPR148Q8TDV2 347 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 MCHR2Q969V1 340 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TCTN2Q96GX1 697 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 LMF1Q96S06 567 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF69Q9UC07 566 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM131Q92545 1883 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 EPOPA6NHQ4 379 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 I3L521 148 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF264O43296 627 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD1-201ENST00000331462 ALDOBP05062 364 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms