RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 RPS15P62841 145 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 RGS21Q2M5E4 152 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 CEP19Q96LK0 163 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 ANGPTL4Q9BY76 406 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 SH2D2AQ9NP31 389 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 ALKBH4Q9NXW9 302 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 GNG8Q9UK08 70 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 FKBP7Q9Y680 259 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD8-201ENST00000313173 LIPT2A6NK58 231 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CHAF1BQ13112 559 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CDK5R1Q15078 307 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM164Q5U3C3 297 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZNX1 250 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PARP16Q8N5Y8 322 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM156Q8N614 296 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF248Q8NDW4 579 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PAQR8Q8TEZ7 354 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R14BQ96C90 147 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CHST11Q9NPF2 352 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SDK2Q58EX2 2172 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 MS4A18H0YCH9 400 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 H3BML4 177 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 MASP2O00187 686 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 IFITM3Q01628 133 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 MS4A18Q3C1V0 323 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SPANXN2Q5MJ10 180 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 C3orf33Q6P1S2 294 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 DHRS13Q6UX07 377 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PLCZ1Q86YW0 608 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ESX1Q8N693 406 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 NTNG2Q96CW9 530 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CCL3P10147 92 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 EIF1P41567 113 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SIRPAP78324 504 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CDC20BQ86Y33 519 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CHPT1Q8WUD6 406 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 AP3S1Q92572 193 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 WDFY2Q96P53 400 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 MNTQ99583 582 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 MARCH7Q9H992 704 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ACOXLQ9NUZ1 547 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 HPF1Q9NWY4 346 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SHISA3A0PJX4 238 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 NPIPB13A6NJU9 1138 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 NPIPB4C9JG80 1138 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CD1AP06126 327 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ADH6P28332 368 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 TNFSF8P32971 234 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC58Q4VC31 144 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF684Q5T5D7 378 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 STPG1Q5TH74 334 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SNX29P2Q8IUI4 249 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 MS4A15Q8N5U1 240 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ABHD4Q8TB40 342 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB8AQ96BR9 441 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM19Q96E16 107 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 B9D1Q9UPM9 204 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087WZY1 265 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 TVP23AA6NH52 213 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 DVL2O14641 736 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 RGS5O15539 181 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 MTNR1BP49286 362 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 TLE3Q04726 772 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 Q0VFX4 171 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 HES3Q5TGS1 186 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PIP4P1Q86T03 277 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 GHSRQ92847 366 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SLC30A2Q9BRI3 323 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 CMAHPQ9Y471 501 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 EML6Q6ZMW3 1958 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM30A4D0T7 59 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 A6NIZ1 184 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SC5DO75845 299 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 HLA-DOBP13765 273 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 GDI2P50395 445 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 DAP3P51398 398 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 RAP1BP61224 184 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 RAP1AP62834 184 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 MYBPHQ13203 477 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 DNASE1L3Q13609 305 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 MELKQ14680 651 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SLC22A10Q63ZE4 541 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL15Q96M94 604 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 INTS14Q96SY0 518 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 WDR76Q9H967 626 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PROK2Q9HC23 129 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SLC22A23A1A5C7 686 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 PRR32B1ATL7 298 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 SNPHO15079 494 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 UPK1BO75841 260 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXD8-201ENST00000313173 AKR7A3O95154 331 aa24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms