RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299022.9

LIPC-201, Transcript of lipase C, hepatic type, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIPC, Length 2,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPC-201ENST00000299022 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 TMEM65Q6PI78 240 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 FAM122BQ7Z309 247 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 NPAS1Q99742 590 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 MMP25Q9NPA2 562 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 CA14Q9ULX7 337 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 EFCAB7A8K855 629 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 UBL3O95164 117 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 OR1D5P58170 312 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 ETFDHQ16134 617 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 PM20D2Q8IYS1 436 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 THEM6Q8WUY1 208 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 TCTN2Q96GX1 697 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 OR10A4Q9H209 315 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa8.97□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 IFITM5A6NNB3 132 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 ZNF879B4DU55 563 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 SCDO00767 359 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 ARL6IP5O75915 188 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 GLCEO94923 617 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 WNT11O96014 354 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 ZNF117Q03924 483 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 GGTLC2Q14390 218 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 MEP1BQ16820 701 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 MDGA2Q7Z553 956 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 SYS1Q8N2H4 156 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 OR2T4Q8NH00 348 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 SCMH1Q96GD3 660 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 LANCL2Q9NS86 450 aa8.96□□□□□ -0.97
LIPC-201ENST00000299022 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 UPK3AO75631 287 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 MMP15P51511 669 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 LGALS3BPQ08380 585 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 SQSTM1Q13501 440 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 TRAM1Q15629 374 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 LANCL3Q6ZV70 420 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 ZNF527Q8NB42 609 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 NUDT9Q9BW91 350 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 CHIAQ9BZP6 476 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 OR51J1Q9H342 316 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 GPR27Q9NS67 375 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 SPATA2Q9UM82 520 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.96□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 POM121CA8CG34 1229 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 ARPC3O15145 178 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 ZNF264O43296 627 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 SERPINA3P01011 423 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 TPOP07202 933 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 CD14P08571 375 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 DCTDP32321 178 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 VEGFCP49767 419 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 SELENOPP49908 381 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 SNTA1Q13424 505 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 GSG1Q2KHT4 349 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
LIPC-201ENST00000299022 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms