RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.7□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF726A6NNF4 738 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PDLIM1O00151 329 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 SLC43A1O75387 559 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 TP53P04637 393 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 APEHP13798 732 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PRKACGP22612 351 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 SLC6A6P31641 620 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 BIDP55957 195 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 MELKQ14680 651 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 TSPO2Q5TGU0 170 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 FAM205BPQ63HN1 556 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 KLHL17Q6TDP4 642 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZT83 130 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 IGFN1Q86VF2 1251 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 WDFY1Q8IWB7 410 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 LRR1Q96L50 414 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 EMC6Q9BV81 110 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 KATNB1Q9BVA0 655 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 GALNT8Q9NY28 637 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 OAZ3Q9UMX2 235 aa11.69□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ARPC3O15145 178 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 TXNDC12O95881 172 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 COX5AP20674 150 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 CD79BP40259 229 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 RPL27P61353 136 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 P2RY6Q15077 328 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 GPR139Q6DWJ6 353 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PARP8Q8N3A8 854 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ATG16L2Q8NAA4 619 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF519Q8TB69 540 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 EGLN3Q9H6Z9 239 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF556Q9HAH1 456 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PTPN13Q12923 2485 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 IMPA2O14732 288 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 UPK3AO75631 287 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-9P01782 118 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 IGHG1P01857 330 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PGA4P0DJD7 388 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PGA3P0DJD8 388 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ACADSP16219 412 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 SDHAP31040 664 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 DAPP51397 102 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 RPS6KA3P51812 740 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ERVK-25P63136 954 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PPP2R2BQ00005 443 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 SORDQ00796 357 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 CAMK2DQ13557 499 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 HIST3H3Q16695 136 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD34AQ69YU3 496 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ACBD4Q8NC06 268 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 NOXO1Q8NFA2 376 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 OR52L1Q8NGH7 329 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 OR8D4Q8NGM9 314 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM54Q969K7 222 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF566Q969W8 418 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 SAMD8Q96LT4 415 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 ASB6Q9NWX5 421 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 KIF17Q9P2E2 1029 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 UPB1Q9UBR1 384 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 IL20RAQ9UHF4 553 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PRR14LQ5THK1 2151 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 A6NIZ1 184 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 SAC3D1A6NKF1 404 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 BHLHE40O14503 412 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 IDH3BO43837 385 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 TRMUO75648 421 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 SOX14O95416 240 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R3DO95685 299 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 CLDN1O95832 211 aa11.67□□□□□ -0.54
CCDC42-201ENST00000293845 OSMP13725 252 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms