RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NAXDQ8IW45 347 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TMIEQ8NEW7 156 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 STK35Q8TDR2 534 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MOKQ9UQ07 419 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 V9GY05 133 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PATJQ8NI35 1801 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SULT1C2O00338 296 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SYT5O00445 386 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RAD1O60671 282 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ITGA10O75578 1167 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RCBTB2O95199 551 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 VAMP1P23763 118 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NFYBP25208 207 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 BDKRB2P30411 391 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CSF2RBP32927 897 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RAB5BP61020 215 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SIRPAP78324 504 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RNF44Q7L0R7 432 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 DIO2Q92813 273 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FGF22Q9HCT0 170 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NRIP3Q9NQ35 241 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 AKAP6Q13023 2319 aa9.93□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A12O75746 678 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 GABRG2P18507 467 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PDX1P52945 283 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NKD1Q969G9 470 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF649Q9BS31 505 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 HRH4Q9H3N8 390 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MED17Q9NVC6 651 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ICKQ9UPZ9 632 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ROS1P08922 2347 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 DNAJC13O75165 2243 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ABCD4O14678 606 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFB6O95139 128 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 IFNGP01579 166 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 UBBP0CG47 229 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 UBA52P62987 128 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SKP1P63208 163 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ACSM1Q08AH1 577 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 KCNAB1Q14722 419 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 GXYLT1Q4G148 440 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF627Q7L945 461 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 C10orf53Q8N6V4 93 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 C5orf51A6NDU8 294 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 IFITM5A6NNB3 132 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NPC1O15118 1278 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RPN2P04844 631 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 DRD1P21728 446 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 CENPAP49450 140 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 TAS2R20P59543 309 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 BDH1Q02338 343 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MED9Q9NWA0 146 aa9.92□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 OR2M5A3KFT3 312 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 HMSDA8MTL9 139 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 MAKP20794 623 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 NT5EP21589 574 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 AKT2P31751 481 aa9.91□□□□□ -0.82
CNGA3-201ENST00000272602 BSGP35613 385 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms