RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 YIPF5Q969M3 257 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 C2orf42Q9NWW7 574 aa8.09□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 H0Y8X5 98 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 F13BP05160 661 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PET100P0DJ07 73 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CLUP10909 449 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 HCCSP53701 268 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 FHL5Q5TD97 284 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PXKQ7Z7A4 578 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TET1Q8NFU7 2136 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PNPLA2Q96AD5 504 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SCMH1Q96GD3 660 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 S1PR5Q9H228 398 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 C5orf51A6NDU8 294 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 C4orf51C9J302 202 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TSPAN4O14817 238 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 AKR7A2O43488 359 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SEMA7AO75326 666 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 IGF2P01344 180 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CDK2P24941 298 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 HTR2CP28335 458 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GPLD1P80108 840 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GALK2Q01415 458 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 INSL4Q14641 139 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZNF74Q16587 644 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CLLU1Q5K131 121 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 COMTD1Q86VU5 262 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZNF511Q8NB15 262 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TMEM106AQ96A25 262 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 MVB12AQ96EY5 273 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ADOQ96SZ5 270 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SOSTQ9BQB4 213 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 A0A0A6YYH2 397 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PS29 197 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 LILRA5A6NI73 299 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 A6NJ64 397 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 A8MVM7 634 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SUSD5O60279 629 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A7O60669 478 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ACHEP22303 614 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OR3A2P47893 321 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 LIMK1P53667 647 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 HTR4Q13639 388 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 C17orf47Q8NEP4 570 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPL8 197 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 XRCC3O43542 346 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ZNF254O75437 659 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ADRA2AP08913 450 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ST6GAL1P15907 406 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SSTR2P30874 369 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 P2RX1P51575 399 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ERV3-1Q14264 604 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TOMM20Q15388 145 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GAB4Q2WGN9 574 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CDNFQ49AH0 187 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 MTFR2Q6P444 385 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 TSSK4Q6SA08 328 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 C3orf49Q96BT1 292 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 SHDQ96IW2 340 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 PHB2Q99623 299 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 CDC6Q99741 560 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
HERC3-201ENST00000264345 GSX2Q9BZM3 304 aa8.07□□□□□ -1.12
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