RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 NSMAFQ92636 917 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 HIST1H2ACQ93077 130 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 RADILQ96JH8 1075 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SLC38A3Q99624 504 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 FKBP7Q9Y680 259 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 DCTN6O00399 190 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF432O94892 652 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ABHD16AO95870 558 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 RENP00797 406 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 MST1P26927 711 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 NUDT1P36639 197 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SOX2P48431 317 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 FNTBP49356 437 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 VEGFCP49767 419 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 MESTQ5EB52 335 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OR6V1Q8N148 313 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 NXPE2Q96DL1 559 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OR10A4Q9H209 315 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 WDR76Q9H967 626 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 C12orf10Q9HB07 376 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 PDE7BQ9NP56 450 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 A0A087WV48 116 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1B0GUH1 482 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TVP23AA6NH52 213 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ACOT7O00154 380 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CDK2P24941 298 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TACR3P29371 465 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 RORAP35398 523 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 MNDAP41218 407 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 P2RX1P51575 399 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ZP1P60852 638 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 EGR3Q06889 387 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ELOCQ15369 112 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OR8H3Q8N146 312 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC74AQ96AQ1 378 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 KLHL15Q96M94 604 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 GUCD1Q96NT3 240 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 UCK1Q9HA47 277 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1W2PQ72 361 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 H7C1C5 153 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 TPPPO94811 219 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ADRA2CP18825 462 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SLC6A8P48029 635 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 LCN6P62502 163 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 OR2T35Q8NGX2 323 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 NOX3Q9HBY0 568 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXD3-201ENST00000249440 LILRA5A6NI73 299 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM212A6NML5 194 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 LEUTXA8MZ59 168 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 PHYHO14832 338 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ALOX5APP20292 161 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF81P51508 661 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 SCAND1P57086 179 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 STPG1Q5TH74 334 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF676Q8N7Q3 588 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXD3-201ENST00000249440 TAAR8Q969N4 342 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms