RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236192.11

VAMP4-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VAMP4-201ENST00000236192 SLC2A12Q8TD20 617 aa11.88□□□□□ -0.51
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
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VAMP4-201ENST00000236192 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
VAMP4-201ENST00000236192 SELENOFO60613 162 aa11.88□□□□□ -0.51
VAMP4-201ENST00000236192 GCGP01275 180 aa11.88□□□□□ -0.51
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