RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ODC1-201ENST00000234111 WNT11O96014 354 aa19.36■□□□□ 0.69
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
ODC1-201ENST00000234111 AGAP20933 346 aa19.36■□□□□ 0.69
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