RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4C16Q8NGL9 310 aa20.14■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 OR9A4Q8NGU2 314 aa20.14■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF417Q8TAU3 575 aa20.14■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SHARPINQ9H0F6 387 aa20.14■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 A8MXK9 166 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CSF1P09603 554 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CT45A8P0DMV1 189 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CT45A9P0DMV2 189 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GABRA1P14867 456 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP3CBP16298 524 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 H2BFSP57053 126 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF74Q16587 644 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CT45A2Q5DJT8 189 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD16Q6P6B7 361 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM81Q6P7N7 255 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF227Q86WZ6 799 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 HCRTR1O43613 425 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINI2O75830 405 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SDHAP31040 664 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 TUSC1Q2TAM9 212 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 BCORP1Q8N888 145 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 OR5M1Q8NGP8 315 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GINS4Q9BRT9 223 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.13■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 KRBOX1C9JBD0 128 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ARPC5O15511 151 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GDI1P31150 447 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 C2orf68Q2NKX9 166 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 FBRSQ9HAH7 460 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 A8MUA0 341 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PRAMEF2O60811 474 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 COL9A1P20849 921 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ALG11Q2TAA5 492 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2AK2Q8NG84 335 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2G2Q8NGZ5 317 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MNTQ99583 582 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 KXD1Q9BQD3 176 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1W2PQF6 199 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PNMTP11086 282 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MPPED2Q15777 294 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PATE1Q8WXA2 126 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 HERVK_113Q902F9 699 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.12■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GGT3PA6NGU5 568 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MAS1P04201 325 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MYOGP15173 224 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 NAGAP17050 411 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CTRB1P17538 263 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CSF2RBP32927 897 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR3P46089 330 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CTXN1P60606 82 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL26Q53HC5 615 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ALG10Q5BKT4 473 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CTRB2Q6GPI1 263 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ELOA3Q8NG57 546 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6M1Q8NGM8 313 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1B0GTH9 108 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM212A6NML5 194 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 F5H5P2 479 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 DCTN6O00399 190 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PGDP52209 483 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 EGR3Q06889 387 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 DMWDQ09019 674 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ALKAL2Q6UX46 152 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR148Q8TDV2 347 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MCHR2Q969V1 340 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MOGAT1Q96PD6 335 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 COMMD4Q9H0A8 199 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 MED11Q9P086 117 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 PFDN2Q9UHV9 154 aa20.11■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 CTAG2O75638 210 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 SIX6O95475 246 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 LPLP06858 475 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 FGF2P09038 288 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 ASAH2BP0C7U1 165 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 EMC4Q5J8M3 183 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1-201ENST00000218364 OR7E24Q6IFN5 339 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms