RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb20Q8K0L9 741 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gal3st1Q9JHE4 423 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psma1Q9R1P4 263 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cnot1Q6ZQ08 2375 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1006A2ALD2 312 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BC035947B2RQY6 695 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm45711E0CXA2 391 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6803J3QPI8 144 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lemd1Q14C37 129 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RflnbQ5SVD0 216 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr151Q60893 309 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Katnb1Q8BG40 658 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mmgt2Q8R3L0 123 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr202Q8VGQ3 307 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc26Q91W20 331 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Emc3Q99KI3 261 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LhppQ9D7I5 270 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr938Q9EQ93 315 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf106O88466 1888 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav8n-2A0A075B633 112 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A0A1W2P799 418 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc25a25A2ASZ8 469 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2-ObO35424 271 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpld1O70362 837 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rad52P43352 420 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif1P48024 113 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem217Q14AF1 189 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Osgin2Q3TEE9 550 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2-M2Q6W9L1 343 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cst14Q8VII3 130 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rp2Q9EPK2 347 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tp73Q9JJP2 631 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bmp10Q9R229 421 aa11.83□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnaset2aC0HKG5 259 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnaset2bC0HKG6 259 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r177E9PXM3 309 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klk1b5P15945 261 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nptx1Q62443 432 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kmt5cQ6Q783 468 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slco4c1Q8BGD4 722 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp9Q8BIS1 454 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ogfrl1Q8VE52 464 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Thoc3Q8VE80 351 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr935Q8VG16 308 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oas1hQ8VI97 369 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prss42Q8VIF2 335 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scn5aQ9JJV9 2019 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7233E9PZI8 198 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9732F6QVC4 198 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8104K7N744 198 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FiglaO55208 194 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FapP97321 761 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EngQ63961 653 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cpeb2Q812E0 521 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kctd20Q8CDD8 419 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc167Q9D162 97 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Asb12Q9D738 308 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufa9Q9DC69 377 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf346Q9R0B7 294 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1018A2ASV3 311 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Muc3E9PWP7 378 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20403G3UYB0 123 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 F10O88947 481 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IghmP01872 454 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2-EaP01904 255 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P04224 255 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr85P60894 370 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim63Q38HM4 350 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc44a5Q5RJI2 710 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 E2f1Q61501 430 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kctd9Q80UN1 339 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wbp1lQ8BGW2 348 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GldnQ8BMF8 549 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r228Q8R2A7 333 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr341Q8VGK9 313 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gorasp1Q91X51 446 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr116Q923Q6 321 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lypd2Q9DD23 127 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fiz1Q9WTJ4 500 aa11.82□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PvrigA0A1B0GS01 234 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13090A2A899 111 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3636E9Q5P1 227 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 InhbbQ04999 411 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r14bQ62084 147 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1166Q7TR27 316 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r201Q8R262 300 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tex29Q9DA77 186 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tsc2Q61037 1814 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Srsf5O35326 269 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl7P14148 270 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptx3P48759 381 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clns1aQ61189 236 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Meig1Q61845 88 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HepacamQ640R3 418 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf629Q6A085 867 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Timd4Q6U7R4 343 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lcn10Q810Z1 182 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc3bQ8VCH9 259 aa11.81□□□□□ -0.52
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1043Q8VFK4 314 aa11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.3 ms