RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFSF4	P23510	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD17B3	P37058	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC1A1	P43005	524 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	XK	P51811	444 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	DLX1	P56177	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYM	Q14894	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	DECR1	Q16698	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PMM1	Q92871	262 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	FCMR	O60667	390 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	UTS2	O95399	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	HLA-H	P01893	362 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	LIPA	P38571	399 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PMEL	P40967	661 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PRIM2	P49643	509 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	IDH3A	P50213	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TERF1	P54274	439 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	DYNLT1	P63172	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MGAT2	Q10469	447 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	RABEP1	Q15276	862 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZRM9	215 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	TAPBP	O15533	448 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB36	O95755	333 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PDYN	P01213	254 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	C8G	P07360	202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440		P0DMU3	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PCSK2	P16519	638 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	OR3A4P	P47883	348 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC9A3	P48764	834 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNAP23-223	ENST00000627440	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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