RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 STMN3Q9NZ72 180 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CYP8B1Q9UNU6 501 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GTQ1 180 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CD14P08571 375 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CDK2P24941 298 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 SDHAP31040 664 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 IKZF1Q13422 519 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ANGPT1Q15389 498 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ZSWIM7Q19AV6 140 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 WBP2NLQ6ICG8 309 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZS52 159 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 OR6V1Q8N148 313 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJA3Q96EY1 480 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 MMP17Q9ULZ9 603 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 BRWD1Q9NSI6 2320 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 H3BSH0 61 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 DCTDP32321 178 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 RAD52P43351 418 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 SOX2P48431 317 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 FNTBP49356 437 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 SLC37A1P57057 533 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CTXN1P60606 82 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CCINQ13939 588 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ELOA3BQ3SY89 546 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ALG10Q5BKT4 473 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA0895LQ68EN5 471 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ELMOD2Q8IZ81 293 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 PRSS35Q8N3Z0 413 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ELOA3Q8NG57 546 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 SEC22CQ9BRL7 303 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa12.13□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CEP290O15078 2479 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 TXNDC12O95881 172 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CFDP00746 253 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 UBL4AP11441 157 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 GFERP55789 205 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 OLFML2AQ68BL7 652 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ARMC6Q6NXE6 501 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 JAZF1Q86VZ6 243 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 PARGQ86W56 976 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ANGPTL6Q8NI99 470 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 C17orf50Q8WW18 174 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 LANCL2Q9NS86 450 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 PIPOXQ9P0Z9 390 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00862A6NCI5 91 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 SSNA1O43805 119 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 IGF2P01344 180 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 MAOBP27338 520 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ADH7P40394 386 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CAPZBP47756 277 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CCR4P51679 360 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00303Q3SY05 128 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 Q499Y3 187 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ELFN2Q5R3F8 820 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 DNM1P46Q6ZS02 220 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 TAAR8Q969N4 342 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 HAVCR1Q96D42 359 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 KLHL9Q9P2J3 617 aa12.12□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ALPK2Q86TB3 2170 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 OR4C45A6NMZ5 311 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 C17orf105B2RV13 164 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 PDCD5O14737 125 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 KRT33AO76009 404 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 TOXO94900 526 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 TGM6O95932 706 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 IFNA16P05015 189 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 KCNAB1Q14722 419 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 GRM7Q14831 915 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ESCO2Q56NI9 601 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 TOR2AQ5JU69 321 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 FAM69AQ5T7M9 428 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 ASPHD2Q6ICH7 369 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa12.11□□□□□ -0.47
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms