RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPX5	O75715	221 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	LIMS1	P48059	325 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	DEFA1	P59665	94 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	DEFA3	P59666	94 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ODF1	Q14990	250 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	GXYLT1	Q4G148	440 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF787	Q6DD87	383 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDC73	Q6P1J9	531 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	BEND4	Q6ZU67	534 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SMPDL3B	Q92485	455 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	UCK2	Q9BZX2	261 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	MKLN1	Q9UL63	735 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TSPAN2	O60636	221 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	IFNW1	P05000	195 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CRISP1	P54107	249 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TEK	Q02763	1124 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6	2e-6	■■■■■ 26.9
RABGEF1-209	ENST00000607882	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	COX18	Q8N8Q8	333 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	MARCH7	Q9H992	704 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882		Q9N2J8	555 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLN6	Q9NWW5	311 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SH3D21	A4FU49	640 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ENTPD6	O75354	484 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCNK	O75909	580 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	APOA1	P02647	267 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARAF	P10398	606 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC15A1	P46059	708 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	COPZ1	P61923	177 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	PMPCA	Q10713	525 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC35A4	Q96G79	324 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	GAL3ST1	Q99999	423 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		11.31	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRRG2	O14669	202 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADAM10	O14672	748 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	FFAR1	O14842	300 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	EMC8	O43402	210 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	FCMR	O60667	390 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	IFNA14	P01570	189 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	RHCE	P18577	417 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CA7	P43166	264 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	DECR1	Q16698	335 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	C4orf17	Q53FE4	359 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRIL	Q7L0X0	811 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	SSX5	O60225	188 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	UTS2	O95399	124 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	BCHE	P06276	602 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TNFSF8	P32971	234 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	TGM4	P49221	684 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	HMGA2	P52926	109 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RABGEF1-209	ENST00000607882	IFITM2	Q01629	132 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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