RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	AMBN	Q9NP70	447 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928		A0A087WV62	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	IRGM	A1A4Y4	181 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928		M0R3H8	397 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CLDN4	O14493	209 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	IGF2	P01344	180 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ALDOB	P05062	364 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NR2F6	P10588	404 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PTGFR	P43088	359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RAB40B	Q12829	278 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NDUFA9	Q16795	377 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PLK5	Q496M5	336 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ABHD13	Q7L211	337 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	EXD3	Q8N9H8	876 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	POM121	Q96HA1	1249 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928		A0A087X0M5	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928		A0A1B0GX30	115 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TLR4	O00206	839 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CD1A	P06126	327 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NGFR	P08138	427 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PPP2CB	P62714	309 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PPP2CA	P67775	309 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	GGTLC2	Q14390	218 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	HGD	Q93099	445 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF524	Q96C55	264 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FGF22	Q9HCT0	170 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	COMMD9	Q9P000	198 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	WASF3	Q9UPY6	502 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM72	A0PK05	275 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TF	P02787	698 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FH	P07954	510 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NOS3	P29474	1203 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	BLK	P51451	505 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	EPHA4	P54764	986 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	DYRK1A	Q13627	763 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CDC73	Q6P1J9	531 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ARL11	Q969Q4	196 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	DVL2	O14641	736 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	OR10H2	O60403	315 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	IL33	O95760	270 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	DRD5	P21918	477 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	SOX3	P41225	446 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	CCR9	P51686	369 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PIGK	Q92643	395 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PBX4	Q9BYU1	374 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	PRSS38	A1L453	326 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FAM74A7	A6NL05	159 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	POM121C	A8CG34	1229 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	EMC8	O43402	210 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FABP5	Q01469	135 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	NHLH2	Q02577	135 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	DMWD	Q09019	674 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	RUNX2	Q13950	521 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	MAPK14	Q16539	360 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	HFE	Q30201	348 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		10	□□□□□ -0.81
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		10	□□□□□ -0.81

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