RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571855.1

ABCC3-218, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

Gene ABCC3, Length 1,562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-218ENST00000571855 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC3-218ENST00000571855 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC3-218ENST00000571855 EMC6Q9BV81 110 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC3-218ENST00000571855 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC3-218ENST00000571855 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC3-218ENST00000571855 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCC3-218ENST00000571855 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC3-218ENST00000571855 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC3-218ENST00000571855 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCC3-218ENST00000571855 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 SLC35F4A4IF30 521 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 CIB2O75838 187 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 F13BP05160 661 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 IFNGR1P15260 489 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 COX5AP20674 150 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 FHL1Q13642 323 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 TSC22D1Q15714 1073 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 TMEM123Q8N131 208 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 OR51A7Q8NH64 312 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 OR2M2Q96R28 347 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 VNN3Q9NY84 501 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 PDLIM1O00151 329 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 OR10H3O60404 316 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 SLC43A1O75387 559 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 LYZL6O75951 148 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 CST1P01037 141 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 LGALS3BPQ08380 585 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 MARVELD3Q96A59 401 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 GPA33Q99795 319 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 REEP1Q9H902 201 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 INIPQ9NRY2 104 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 U3KQV3 271 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ABCA4P78363 2273 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 A0A1W2PRG6 482 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 SH3D21A4FU49 640 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ZNF726A6NNF4 738 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 CLOCKO15516 846 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 KLF4O43474 513 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 FKBP6O75344 327 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 UPK3AO75631 287 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 KRT33AO76009 404 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 IL32P24001 234 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 IFNGR2P38484 337 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 BIDP55957 195 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 CCNIQ14094 377 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ZBED5Q49AG3 693 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ALG10Q5BKT4 473 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 OR6X1Q8NH79 312 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 FAM222BQ8WU58 562 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 DACH2Q96NX9 599 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 OR10A4Q9H209 315 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 YY1AP1Q9H869 796 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 PTP4A3O75365 173 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 BCL10O95999 233 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ITGA5P08648 1049 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 EPXP11678 715 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 PPP3CBP16298 524 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 MPGP29372 298 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 PRPS1P60891 318 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 CAMK2DQ13557 499 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 CARD17Q5XLA6 110 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 LINGO2Q7L985 606 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 LINC00471Q8N535 108 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 S100PBPQ96BU1 408 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 LRR1Q96L50 414 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCC3-218ENST00000571855 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.8 ms