RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.1□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 VSTM5A8MXK1 200 aa3.09□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 PLPP1O14494 284 aa3.09□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 SYNGR3O43761 229 aa3.09□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 FOXH1O75593 365 aa3.09□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ZNF432O94892 652 aa3.09□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 C17orf67Q0P5P2 114 aa3.09□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 GPX6P59796 221 aa3.08□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
HERC1-211ENST00000560983 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
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