RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
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RABGGTA-207ENST00000558936 UBOX5O94941 541 aa11.03□□□□□ -0.64
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RABGGTA-207ENST00000558936 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.03□□□□□ -0.64
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RABGGTA-207ENST00000558936 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGGTA-207ENST00000558936 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
RABGGTA-207ENST00000558936 ALPK1Q96QP1 1244 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTA-207ENST00000558936 EPYCQ99645 322 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTA-207ENST00000558936 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGGTA-207ENST00000558936 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGGTA-207ENST00000558936 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTA-207ENST00000558936 NANSQ9NR45 359 aa11.03□□□□□ -0.64
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