RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR52W1Q6IF63 320 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 UEVLDQ8IX04 471 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC35G1Q2M3R5 365 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 SYT4Q9H2B2 425 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 CD3GP09693 182 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 ETFAP13804 333 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ARSBP15848 533 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 AESQ08117 197 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC73Q5JTD7 316 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 SHISA4Q96DD7 197 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 PAAF1Q9BRP4 392 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 UBQLN3Q9H347 655 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 A0A0D9SEW6 157 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC57Q8N9N7 239 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SUMF2Q8NBJ7 301 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRB-210ENST00000551525 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SLC45A3Q96JT2 553 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF583Q96ND8 569 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 GUCD1Q96NT3 240 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OR7D2Q96RA2 312 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 TAAR9Q96RI9 348 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 LYSMD1Q96S90 227 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 OARD1Q9Y530 152 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRB-210ENST00000551525 VSTM2BA6NLU5 285 aa5.84□□□□□ -1.47
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