RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534111.5

TMPRSS4-218, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene TMPRSS4, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-218ENST00000534111 OPRM1P35372 400 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 PGAP1Q75T13 922 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 TMEM68Q96MH6 324 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 M0R082 166 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 DOK2O60496 412 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 PAHP00439 452 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 SERPINA5P05154 406 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 PRPH2P23942 346 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 ERVK-16P61578 105 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 BEND4Q6ZU67 534 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 METTL15A6NJ78 407 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 MASP2O00187 686 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 NUDT7P0C024 238 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 TBXA2RP21731 343 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 GABRR1P24046 479 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 TMEM163Q8TC26 289 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 MUS81Q96NY9 551 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 B4DXG7 233 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 UPK1AO00322 258 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 RBBP9O75884 186 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 SNAP29O95721 258 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 ACTL6AO96019 429 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 BMP2P12643 396 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 WDR34Q96EX3 536 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 MED16Q9Y2X0 877 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa9.59□□□□□ -0.87
TMPRSS4-218ENST00000534111 LRRN3E7EW58 273 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 MAS1P04201 325 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 FPR3P25089 353 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 EMC4Q5J8M3 183 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 THEM4Q5T1C6 240 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZNF425Q6IV72 752 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 ALG12Q9BV10 488 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 NELFAQ9H3P2 528 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 SOX8P57073 446 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 CDC20Q12834 499 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 SCGB2A2Q13296 93 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 KEAP1Q14145 624 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 PLAG1Q6DJT9 500 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 TMEM200AQ86VY9 491 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 FCAMRQ8WWV6 532 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 PSMF1Q92530 271 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 MGLLQ99685 303 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 SYT3Q9BQG1 590 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 SMCO3A2RU48 225 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 DBHP09172 617 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 GALNSP34059 522 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 MAGEA2P43356 314 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 GRK1Q15835 563 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 LIPKQ5VXJ0 399 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 ASRGL1Q7L266 308 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 CCDC120Q96HB5 630 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 METTL9Q9H1A3 318 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 SLC2A5P22732 501 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 ABCD3P28288 659 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 GIPRP48546 466 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 NFATC3Q12968 1075 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 SLC35D3Q5M8T2 416 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 TIGD3Q6B0B8 471 aa9.58□□□□□ -0.88
TMPRSS4-218ENST00000534111 NPRL2Q8WTW4 380 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.6 ms