RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 P2RY14Q15391 338 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 CBLN3Q6UW01 205 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 COX15Q7KZN9 410 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 OAFQ86UD1 273 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 Q8N402 240 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 OR4F15Q8NGB8 312 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 STT3BQ8TCJ2 826 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 RFKQ969G6 155 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 IFT27Q9BW83 186 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 RERGLQ9H628 205 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 MED20Q9H944 212 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 MED17Q9NVC6 651 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 TTC28Q96AY4 2481 aa7.51□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 LRRN3E7EW58 273 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 SCDO00767 359 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 SULT1B1O43704 296 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 S100A6P06703 90 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 ATP6V1E1P36543 226 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 ARHGDIBP52566 201 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 EBPQ15125 230 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 RNLSQ5VYX0 342 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 LNX2Q8N448 690 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 ZNF527Q8NB42 609 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 EMC3Q9P0I2 261 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 COPZ2Q9P299 210 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 FRG2CA6NGY1 282 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 HCN1O60741 890 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 SDHBP21912 280 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 FOXK2Q01167 660 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 NAT6Q93015 286 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 CFAP54Q96N23 3096 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 A0A087WUJ7 227 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 GMFGO60234 142 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 ICOSLGO75144 302 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 SCRG1O75711 98 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 PPP1R3DO95685 299 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 FABP1P07148 127 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 LIMS3P0CW19 117 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 LIMS4P0CW20 117 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 SELLP14151 372 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 HTR1FP30939 366 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 HSF2Q03933 536 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 LPAL2Q16609 132 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 PHF19Q5T6S3 580 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 NANPQ8TBE9 248 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 TM9SF4Q92544 642 aa7.5□□□□□ -1.21
SOX6-210ENST00000528252 C3orf49Q96BT1 292 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms