RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524095.5

CLVS1-211, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLVS1, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-211ENST00000524095 CFLARO15519 480 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 SLC43A1O75387 559 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 FOXH1O75593 365 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 TSPAN15O95858 294 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 NGFP01138 241 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 TFPTP0C1Z6 253 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 GKN3PP0CG01 181 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF250P15622 560 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF12P17014 697 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 MAKP20794 623 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 CXCR1P25024 350 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 MTNR1AP48039 350 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 GIPRP48546 466 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 DNAJB13P59910 316 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 TEKQ02763 1124 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 EPS8Q12929 822 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 PTGR1Q14914 329 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 RAB39AQ14964 217 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 GSTA3Q16772 222 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 GSG1Q2KHT4 349 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 GALNTL6Q49A17 601 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 SPRNQ5BIV9 151 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF627Q7L945 461 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 CMIPQ8IY22 773 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM123Q8N131 208 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 NATD1Q8N6N6 113 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 OR4F5Q8NH21 305 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 CCL17Q92583 94 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 UBE2FQ969M7 185 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ROPN1LQ96C74 230 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 OR2M2Q96R28 347 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 GAL3ST1Q99999 423 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 NPHS2Q9NP85 383 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 POLE3Q9NRF9 147 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 EXD2Q9NVH0 621 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 RLIMQ9NVW2 624 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.2□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 AGAP5A6NIR3 686 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 MS4A18H0YCH9 400 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 H3BQF6 201 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 PEX11AO75192 247 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 CLPXO76031 633 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 UBOX5O94941 541 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 NDUFA7O95182 113 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 SERPINA5P05154 406 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 FGF4P08620 206 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 SBK2P0C263 348 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 MYL2P10916 166 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 PNMTP11086 282 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 CCL2P13500 99 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF43P17038 809 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 HPCAL1P37235 193 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 SLC6A9P48067 706 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 RAG2P55895 527 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ERVS71-1P61550 626 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 GALK2Q01415 458 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 PAX2Q02962 417 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 EGR4Q05215 589 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 CHI3L2Q15782 390 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 HFEQ30201 348 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 FAM153CQ494X1 144 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 LCA5Q86VQ0 697 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 SKA3Q8IX90 412 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 ANKFN1Q8N957 763 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 LINC01006Q8NI28 216 aa6.19□□□□□ -1.42
CLVS1-211ENST00000524095 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms