RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTRT2Q8TDY3 377 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 STMN2Q93045 179 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 WDR34Q96EX3 536 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM11Q96F44 468 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAX2Q96IS3 184 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPAN32Q96QS1 320 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4C12Q96R67 309 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 F2RL3Q96RI0 385 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDNQ99608 321 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM246Q9BRR3 403 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCL2L14Q9BZR8 327 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIRPDQ9H106 197 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 GBA3Q9H227 469 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNN2Q9H2S1 579 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 COQ10BQ9H8M1 238 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 C3orf14Q9HBI5 128 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 GCM1Q9NP62 436 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBCCD1Q9NVR7 557 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM53CQ9NYF3 392 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACTR3BQ9P1U1 418 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 IP6K2Q9UHH9 426 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCF19Q9Y242 345 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 MED16Q9Y2X0 877 aa1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SHISA3A0PJX4 238 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 HTR3EA5X5Y0 456 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF716A6NP11 495 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 B4DXG7 233 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BNH8 94 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM178BH3BS89 294 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 LGALS9O00182 355 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAP18O00422 153 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OVOL1O14753 267 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPA12AO43301 675 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10H3O60404 316 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 FADS1O60427 444 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 COQ9O75208 318 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPPPO94811 219 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNH1O95259 989 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 UTS2O95399 124 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 YEATS4O95619 227 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ECDO95905 644 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBD3O95983 291 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDYNP01213 254 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFNA21P01568 189 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFNA5P01569 189 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFNA17P01571 189 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 LPLP06858 475 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINGO3P0C6S8 592 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC172P0C7W6 258 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCNAP12004 261 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CPMP14384 443 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 UCHL3P15374 230 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF250P15622 560 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADRA1AP35348 466 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR3A4PP47883 348 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 NR2C2P49116 596 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCR4P51679 360 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBE2E1P51965 193 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC16A1P53985 500 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDH13P55290 713 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 CORO7P57737 925 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2B6P58173 313 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 BLCAPP62952 87 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PHEXP78562 749 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR5P85299 388 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PITPNAQ00169 270 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSF2Q03933 536 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC18A2Q05940 514 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFRSF9Q07011 255 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIGFQ07326 219 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPS8Q12929 822 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 KLRD1Q13241 179 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRT31Q15323 416 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 FXNQ16595 210 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUSP5Q16690 384 aa1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBC1D28Q2M2D7 210 aa1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms