RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 SEC14L2O76054 403 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 BGLAPP02818 100 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 IGHV4-31P0DP07 118 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 ARR3P36575 388 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 PPOXP50336 477 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 GGTLC2Q14390 218 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 MS4A18Q3C1V0 323 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 CARD17Q5XLA6 110 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 DHDDSQ86SQ9 333 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC36Q8IYA8 594 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 C11orf65Q8NCR3 313 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 KCNK17Q96T54 332 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM160Q9NX00 188 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 USP22Q9UPT9 525 aa21.4■■□□□ 1.02
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 TPST2O60704 377 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 MFN2O95140 757 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 HPRP00739 348 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 FAM157CP0CG43 387 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 HLA-DOBP13765 273 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 CDH12P55289 794 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 PUDPQ08623 228 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 PMS2P3Q13401 168 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 CARTPTQ16568 116 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 CYP51A1Q16850 503 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 RUNDC3AQ59EK9 446 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 PHYHD1Q5SRE7 291 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 MDP1Q86V88 176 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 C20orf196Q8IYI0 205 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 SMYD1Q8NB12 490 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 STON2Q8WXE9 905 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 MOGAT1Q96PD6 335 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 WFDC6Q9BQY6 131 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM43Q9BTV4 400 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 EMC6Q9BV81 110 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 MED29Q9NX70 200 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 NOX1Q9Y5S8 564 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 ATRQ13535 2644 aa21.39■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa21.38■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa21.38■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 M0R3H8 397 aa21.38■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 NR4A2P43354 598 aa21.38■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 HGFACQ04756 655 aa21.38■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 RBBP4Q09028 425 aa21.38■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 PTOV1Q86YD1 416 aa21.38■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 LRR1Q96L50 414 aa21.38■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 NDUFAF1Q9Y375 327 aa21.38■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 SLC35F4A4IF30 521 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 VSTM5A8MXK1 200 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 hCG_2039718K7EN88 272 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 ANGPT2O15123 496 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 FMO6PO60774 539 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 OPN1SWP03999 348 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 THBS4P35443 961 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 GZMKP49863 264 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 MTPNP58546 118 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF613Q6PF04 617 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD27Q96NW4 1050 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 MCHR1Q99705 422 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGDIGQ99819 225 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 RAB1BQ9H0U4 201 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 LPAR3Q9UBY5 353 aa21.37■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 RNF212BA8MTL3 300 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 LRRN3E7EW58 273 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 NPR2P20594 1047 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 AHCYP23526 432 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 SNX32Q86XE0 403 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 DPP10Q8N608 796 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 IL17RDQ8NFM7 739 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 CGREF1Q99674 301 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 BEX2Q9BXY8 128 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 ULBP2Q9BZM5 246 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 NOX3Q9HBY0 568 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM33Q9UPN9 1127 aa21.36■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 COL6A5A8TX70 2615 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 RTTNQ86VV8 2226 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF726A6NNF4 738 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 CHP2O43745 196 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 SERPINI2O75830 405 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 MT-ATP6P00846 226 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 HLA-HP01893 362 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 CAMK2DQ13557 499 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 SELPLGQ14242 412 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 DUSP7Q16829 419 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 GSG1Q2KHT4 349 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF813Q6ZN06 617 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA21Q7Z572 469 aa21.35■■□□□ 1.01
ALYREF-203ENST00000511412 PXKQ7Z7A4 578 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms