RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PDE7BQ9NP56 450 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MED17Q9NVC6 651 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 COPS3Q9UNS2 423 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CACNG2Q9Y698 323 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MEIOCA2RUB1 952 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C17orf51A8MQB3 221 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LINC00587B1AMM8 73 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C17orf105B2RV13 164 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 F8W036 122 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HPGDSO60760 199 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DPB1P04440 258 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HPGDP15428 266 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ARL4DP49703 201 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR1D5P58170 312 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR12D2P58182 307 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF613Q6PF04 617 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GID4Q8IVV7 300 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 BCORP1Q8N888 145 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 WDR54Q9H977 334 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 KLHL1Q9NR64 748 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CMC2Q9NRP2 79 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF292O60281 2723 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OIP5O43482 229 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF2O60811 474 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PTP4A3O75365 173 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IGHA1P01876 353 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 APOC1P02654 83 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PYCR1P32322 319 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ETV6P41212 452 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ATP12AP54707 1039 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HSD17B7P56937 341 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SKP1P63208 163 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C1orf189Q5VU69 101 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 VASNQ6EMK4 673 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 D2HGDHQ8N465 521 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TCEAL3Q969E4 200 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TRIM2Q9C040 744 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SRRQ9GZT4 340 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.392e-7■■□□□ 11.7
HERC4-211ENST00000492996 MMP28Q9H239 520 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HPF1Q9NWY4 346 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RDH8Q9NYR8 311 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MCIDASD6RGH6 385 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PSMD9O00233 223 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SHC1P29353 583 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 GRPRP30550 384 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 P2RY14Q15391 338 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF124Q15973 351 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TP53I3Q53FA7 332 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CBLN3Q6UW01 205 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RTL4Q6ZR62 310 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SSX6Q7RTT6 188 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C4orf36Q96KX1 117 aa6.38□□□□□ -1.39
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