RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ADO	Q96SZ5	270 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TEAD3	Q99594	435 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LPAR4	Q99677	370 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51E2	Q9H255	320 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FKRP	Q9H9S5	495 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HMG20A	Q9NP66	347 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MMP25	Q9NPA2	562 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS50	Q9UI38	385 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIO	O75962	3097 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0A6YYJ9	748 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247		A8MUA0	341 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	REM1	O75628	298 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFAND5	O76080	213 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX4	O95219	450 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1R3D	O95685	299 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CH25H	O95992	272 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IL1A	P01583	271 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHM	P01871	453 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	BGLAP	P02818	100 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CD14	P08571	375 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SBK2	P0C263	348 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HPGD	P15428	266 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF12	P17014	697 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CD40LG	P29965	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MPL	P40238	635 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OPRL1	P41146	370 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RFX3	P48380	749 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	DIO1	P49895	249 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R43	P59537	309 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HSF2	Q03933	536 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LTB	Q06643	244 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LGALS3BP	Q08380	585 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CBFB	Q13951	182 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CRMP1	Q14194	572 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GALE	Q14376	348 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GRINA	Q7Z429	371 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SYS1	Q8N2H4	156 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FNDC8	Q8TC99	324 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR119	Q8TDV5	335 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ELP5	Q8TE02	316 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NACC2	Q96BF6	587 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	WDFY2	Q96P53	400 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZPBP	Q9BS86	351 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPO	Q9BU64	300 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CRB3	Q9BUF7	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	IFT27	Q9BW83	186 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SPRY4	Q9C004	299 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MARCH7	Q9H992	704 aa		5.01	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.7 ms