RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483212.1

USP4-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 727 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-210ENST00000483212 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 RASD1Q9Y272 281 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.36□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 SH3D21A4FU49 640 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 CCDC182A6NF36 153 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 FAM183AA6NL82 134 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 RNF13O43567 381 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 XPNPEP2O43895 674 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 CYTIPO60759 359 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 OR6A2O95222 327 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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USP4-210ENST00000483212 ADRA2AP08913 450 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 FREM3P0C091 2139 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 CCDC159P0C7I6 412 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 SMIM18P0DKX4 95 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 IFNGR1P15260 489 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 AHCYP23526 432 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 SLC15A1P46059 708 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 TDGF1P3P51864 188 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 SLC16A1P53985 500 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 CARD18P57730 90 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 HSF1Q00613 529 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 RUNX1T1Q06455 604 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 ITGADQ13349 1161 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 MELKQ14680 651 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 PDSS1Q5T2R2 415 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP4-210ENST00000483212 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 SLC35D2Q76EJ3 337 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 CPOQ8IVL8 374 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 ZNF786Q8N393 782 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 MEIOBQ8N635 442 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 OR4K13Q8NH42 304 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 RNF128Q8TEB7 428 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 SGCDQ92629 289 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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USP4-210ENST00000483212 GPR137Q96N19 417 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 OXGR1Q96P68 337 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 SNX18Q96RF0 628 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 NMNAT3Q96T66 252 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP4-210ENST00000483212 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 DUSP21Q9H596 190 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 LDAHQ9H6V9 325 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 MED29Q9NX70 200 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.35□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP4-210ENST00000483212 A0A1B0GTH9 108 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 OR6C68A6NDL8 312 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 ZNHIT1O43257 154 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 PRODHO43272 600 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 AQP8O94778 261 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 VAMP5O95183 116 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 TNFAIP8O95379 198 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 IFNGP01579 166 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 HTR1AP08908 422 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 CLUP10909 449 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 NTF4P34130 210 aa7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP4-210ENST00000483212 SLC25A1P53007 311 aa7.34□□□□□ -1.23
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