RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 AASSQ9UDR5 926 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ERGIC3Q9Y282 383 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 DMDP11532 3685 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 GPX5O75715 221 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TFP02787 698 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 LCKP06239 509 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PGA4P0DJD7 388 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PGA3P0DJD8 388 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 SPTBP11277 2137 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 CCNA2P20248 432 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 CYB561P49447 251 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 GUSBP1Q15486 140 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 USP43Q70EL4 1123 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM123Q8N131 208 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ASB17Q8WXJ9 295 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TM9SF4Q92544 642 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 LINC00470Q9BZP3 86 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 MED11Q9P086 117 aa5.78□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 IL1AP01583 271 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CPN1P15169 458 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF708P17019 499 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 AQP2P41181 271 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CCR9P51686 369 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RAC3P60763 192 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PIGFQ07326 219 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MYBPHQ13203 477 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 MDGA2Q7Z553 956 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR2T4Q8NH00 348 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CMTM3Q96MX0 182 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR5M11Q96RB7 305 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TEKT2Q9UIF3 430 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 LAMA1P25391 3075 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 OR5H15A6NDH6 313 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 M0R129 80 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CYTIPO60759 359 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TPPPO94811 219 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SLC34A2O95436 690 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NUDT14O95848 222 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ACTL6AO96019 429 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 IGLV3-1P01715 115 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NR2C1P13056 603 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CFL1P23528 166 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PCSK6P29122 969 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NOS3P29474 1203 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CRABP1P29762 137 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CDC20Q12834 499 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 RIN1Q13671 783 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 THEM4Q5T1C6 240 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GATSQ8NAP1 163 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 IL17BQ9UHF5 180 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 B9D1Q9UPM9 204 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF716A6NP11 495 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 C17orf51A8MQB3 221 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF724A8MTY0 619 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 GPRIN2O60269 458 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SLC25A12O75746 678 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 SP1P08047 785 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 LHX2P50458 406 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ISLR2Q6UXK2 745 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 ZNRF4Q8WWF5 429 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.77□□□□□ -1.49
PRKCI-202ENST00000476635 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms