RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 ERFP50548 548 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RAB25P57735 213 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CXCR4P61073 352 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CSNK2BP67870 215 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 EFR3AQ14156 821 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ACAP2Q15057 778 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 NEDD8Q15843 81 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CTF1Q16619 201 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.9□□□□□ -1.3
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SZRD1-208ENST00000476423 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.9□□□□□ -1.3
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SZRD1-208ENST00000476423 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 POC5Q8NA72 575 aa6.9□□□□□ -1.3
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SZRD1-208ENST00000476423 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.9□□□□□ -1.3
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SZRD1-208ENST00000476423 TMEM80Q96HE8 168 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.9□□□□□ -1.3
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SZRD1-208ENST00000476423 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.9□□□□□ -1.3
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SZRD1-208ENST00000476423 ADA2Q9NZK5 511 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.9□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.9□□□□□ -1.3
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SZRD1-208ENST00000476423 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.9□□□□□ -1.3
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SZRD1-208ENST00000476423 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SZRD1-208ENST00000476423 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.89□□□□□ -1.31
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SZRD1-208ENST00000476423 PLOD3O60568 738 aa6.89□□□□□ -1.31
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SZRD1-208ENST00000476423 UGT2B17O75795 530 aa6.89□□□□□ -1.31
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SZRD1-208ENST00000476423 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.311e-7■■□□□ 14
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SZRD1-208ENST00000476423 UGT2B15P54855 530 aa6.89□□□□□ -1.31
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SZRD1-208ENST00000476423 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF524Q96C55 264 aa6.89□□□□□ -1.31
SZRD1-208ENST00000476423 RNF145Q96MT1 663 aa6.89□□□□□ -1.31
SZRD1-208ENST00000476423 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.89□□□□□ -1.31
SZRD1-208ENST00000476423 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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