RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 SLC35F4A4IF30 521 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 GMNCA6NCL1 334 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 TNFRSF1BP20333 461 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 LSP1P33241 339 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 RBM34P42696 430 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 OR1E2P47887 323 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 AGAP6Q5VW22 663 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 NHLRC1Q6VVB1 395 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 TPD52L3Q96J77 140 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 Q96MF0 132 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 DHRS9Q9BPW9 319 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 PRSS27Q9BQR3 290 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 BDH2Q9BUT1 245 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 CRLF2Q9HC73 371 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 RIMS3Q9UJD0 308 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 VPS13CQ709C8 3753 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 A0A096LPE4 126 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 A0A1W2PPZ6 126 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 E7EQL1 145 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 GSTA4O15217 222 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 SNX3O60493 162 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 THRBP10828 461 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 IFNA8P32881 189 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 NUDT2P50583 147 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 SLC7A2P52569 658 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 RIPPLY3P57055 190 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 ARF1P84077 181 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 ZP4Q12836 540 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 CEACAM16Q2WEN9 425 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 DTX2Q86UW9 622 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 C20orf196Q8IYI0 205 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 TXNDC15Q96J42 360 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 HS6ST2Q96MM7 605 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 EMC6Q9BV81 110 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 MED29Q9NX70 200 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 ACANP16112 2415 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 MTORP42345 2549 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 C11orf98E9PRG8 122 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 M0R3G1 203 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 MT-ND1P03886 318 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 UMPSP11172 480 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 DRD4P21917 467 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 PRDX6P30041 224 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 TTKP33981 857 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 SPOCK1Q08629 439 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 CARD17Q5XLA6 110 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC36Q8IYA8 594 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 TAS2R5Q9NYW4 299 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 CXCR6O00574 342 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 NME4O00746 187 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 RNF13O43567 381 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 SERPINI2O75830 405 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 IGF2P01344 180 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 CD8AP01732 235 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 INHBBP09529 407 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 ASAH2BP0C7U1 165 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 ETFDHQ16134 617 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 C3orf36Q3SXR2 165 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF544Q6NX49 715 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 BIVMQ86UB2 503 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 FBXL14Q8N1E6 418 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 LRRC17Q8N6Y2 441 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 FAM169BQ8N8A8 192 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM239Q8WW34 195 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 NELFAQ9H3P2 528 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 ATP23Q9Y6H3 246 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 USF3Q68DE3 2245 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 IFNGR1P15260 489 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 CDKN1AP38936 164 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 GSK3BP49841 420 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 FABP6P51161 128 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 BIDP55957 195 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 ST3GAL3Q11203 375 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 CAMK2DQ13557 499 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 PHYHD1Q5SRE7 291 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 SLC35D2Q76EJ3 337 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 MUC15Q8N387 334 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 OR6X1Q8NH79 312 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPN4-208ENST00000460289 CBLN4Q9NTU7 201 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms